運輸是木包裝箱的一個重要的作用，一些包裝箱廠用于搬運貨物，節省資源，節省時間。在運輸中也存在一定的問題，如有不慎也會給木箱造成損害。
　　運輸過程中的問題
　　一、運載工具不清潔造成包裝箱污染。如承載過煤炭、化肥、農藥等物質后，對運載工具不及時清洗會對再次運輸的貨物造成損害或污染。
　　二、運輸途中不加蓋蓬布造成雨淋、日曬，這也會造成包裝箱破損、退色、老化等，在運輸途中，尤其是長途運輸，一定要加蓋蓬布進行防雨、防日曬。
　　三、裝載方法不當造成的木包裝箱損害
　　1.裝載貨物不實，貨與貨之間有空隙，在運輸途中造成貨物之間互相碰撞、摩擦。
　　2.裝載貨物倒置使內裝物液體滲漏對其它包裝箱浸泡和污染。
　　3.貨物在運載工具上的堆碼不當，使底層貨物承載過重，造成包裝箱破損。
　　除此之外，木包裝箱在運輸過程中還有來自于汽車、火車、輪船、飛機等交通工具的振動等等，大家一定要采取相應的措施。